Похоже проблема в 7 винде! Установил на другом компе под ХР! Все установилось без проблем!
В чем могет быть засада? Под 7 вин. ставил и 32 и 64 варианты, не работают одинаково!
Сразу следующий вопрос! CYGWIN установил на c:\cygwin, а куда заливать свои .мр исходники и куда устанавливать mp2shp? Директорий там немеряно!